Elle comprend trois étapes : la glycolyse (dans le cytoplasme, dégradation du glucose en pyruvate, 2 ATP), le cycle de Krebs (dans la matrice mitochondriale, 2 ATP), et la chaîne de transport des électrons / phosphorylation oxydative (dans la membrane interne mitochondriale, ~34 ATP). Bilan global : 1 glucose + 6O₂ → 6CO₂ + 6H₂O + ~38 ATP.
Un muscle en activité intense peut consommer jusqu'à 1 kg d'ATP par heure. Sans l'apport continu d'oxygène, la cellule bascule vers la fermentation lactique (production de lactate) qui produit seulement 2 ATP par glucose et cause la fatigue musculaire.
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